El Colegio "Nuestra Señora de la Merced" es patrocinado por la Orden de la Merced, institución religiosa fundada el 10 de agosto de 1218 bajo la advocación y patrocinio de nuestra madre Bienaventurada Virgen María de la Merced. Funciona oficialmente por Resolución Ministerial Nº 5833 del 3 de Junio de 1960 y su ampliación por Resolución Ministerial Nº 003028 del 15 de Julio de 1977.

Los Padres Mercedarios presentes desde la fundación de la Urbanización de Mirones Bajo del Cercado de Lima, brindan un servicio espiritual y seguimiento de Cristo desde el carisma redentor de su fundador y padre San Pedro Nolasco.